母羊凍精配種的輸精部位以輸精管插入子宮頸口1.5-2厘米深度為宜。為將精液準確地輸入到母羊子宮體內，可以在羊用B超的監視下進行，其具體操作方法是:事先將接受輸精的母羊保定于配種架上，使其母羊后肢抬高離地面8-10厘米，也可由一人雙腿夾住母羊的頭頸部，雙手抓住母羊的兩肢后腿，將母羊后軀略微抬高，保持后高前低的姿勢，輸精者將消毒好的開腔器(或內窺鏡)外擦凡士林等潤滑劑，輕輕地插入母羊陰道內，按壓開腔器張開陰道，然后借助光源找到子宮頸口，將裝有細管的輸精管***討準子宮頸口，慢慢旋轉式地插入子宮頸口內約1.5-2厘米時，即可緩慢輸入精液，再抽出輸精管，也可在羊用B超的監視下進行此工作。
在實施輸精操作過程中，給母羊插入開腔器(或內窺鏡)和輸精管時動作要輕緩。如遇母羊擺動劇烈，輸精者要順水推舟，隨母羊擺動而擺動，并要通過羊用B超監視，以防損傷母羊的生殖道;如遇母羊因輸精管的插入和注入精液的刺激而導致努責，則應暫停輸精管插入和暫停精液注入動作，待母羊安靜后再繼續實施輸精過程，以免母羊努責導致輸精管插入受阻，甚至導致注入的精液倒流。此外,輸精結束后，可用手輕輕拍打母羊的后軀,并讓母羊在原地休息10-15分鐘。以利于輸入精液向子宮深處游走。同時，剛輸精的母羊應避免強烈的驅趕運動，避免應激反應降低凍精配種受胎率，配種后，要使用羊用B超來進行診斷。
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