馬用B超機在母馬妊娠期間檢測雙胞胎和監測胎兒健康狀況方面非常有用。超聲波用于生病的晚期懷孕母馬，以確定胎盤的健康狀況。經直腸超聲檢查在妊娠早期更有用，而經直腸和經腹超聲在妊娠中期至晚期均有用。在妊娠晚期，經直腸超聲允許操作者評估宮頸區域的胎盤完整性，這是***有可能開始上行感染的地方。經腹超聲可以更全面地評估胎兒和子宮胎盤，尤其是牛角與身體相連的地方，這是***容易發生諾卡菌感染的區域。
超聲檢查顯示胎盤完整性、胎兒活力、尿囊和羊水的質量/數量，還可用于評估胎心率、尋找雙胞胎和確認胎位。胎兒大小（以及在某種程度上的孕齡/成熟度）可以通過主動脈直徑測量（正常足月馬胎兒為 2.2-2.5 厘米）和胎兒眼眶大小的測量來估計。然而，在妊娠晚期很難找到胎頭。
在高危母馬的妊娠晚期，應經常進行經腹超聲檢查，以發現胎兒窘迫的早期跡象。建議每周進行一次超聲檢查，直到或除非發現異常，然后建議每天進行監測。正常的子宮胎盤厚度應為 0.7-1.5 厘米，幾乎沒有分離的跡象。
胎盤在未懷孕的牛角中會有更多的波紋外觀，這不應與胎盤分離相混淆。子宮胎盤厚度增加提示胎盤水腫或炎癥。羊水和尿囊液應該主要是低回聲的，其中漂浮著少量的小回聲顆粒。隨著分娩的臨近，回聲顆粒增加。
母馬的胎兒活力是通過胎心率、運動、音調和呼吸來估計的。在未鎮靜的母馬中，心動過緩表明胎兒壓力。嚴重的心動過速通常發生在胎兒死亡之前。對胎兒的氧氣輸送不足會導致胎心率反應性喪失（即心臟不隨胎動而加速），隨后會導致胎兒呼吸減少、胎動減少和胎音降低。羊水量減少可能表明慢性宮內壓力和缺氧。
馬用B超機是一種安全、非侵入性的檢測方法。能夠進行經腹或心臟超聲檢查的設備可能很昂貴，因此并非在每個私人診所中都可用。然而，超聲檢查是轉診至二級或三級護理機構的常見原因。
