獸用B超機是現代獸醫***常用的檢測設備之一，在對馬做檢測時主要檢測肌腱和妊娠。母馬配種12到14天后就可以準確的檢測出是否懷孕，而直腸觸診需要在35天后才可以，需要注意的是在直腸觸診小母馬的時候容易造成直腸撕裂，所以直腸觸診通常不是一個非常安全的選擇。母馬通過包裹尾巴然后排空直腸來準備經直腸超聲檢查，然后將探頭插入直腸并觀察子宮的橫截面。
獸用B超機對母馬的發情檢測：
因為母馬的卵子只能存活約 12 小時，而精子的存活時間***長可達 72 小時，因此對即將排卵進行超聲波檢查是明智的。使用這種技術，可以在母馬排卵前的 12 到 24 小時內獲得精液。母馬發情時受雌激素影響的子宮，呈現出典型的“馬車車輪”外觀，這是由于子宮皺襞充滿水腫所致。可以看到每個卵巢上的卵泡。通常一個卵巢上的卵泡會成為優勢。當它的直徑長到 35 到 40 毫米時，可以給母馬施用 HCG 或 Ovuplant 以使其排卵。然后可以在授精后再次使用獸用B超機來確認排卵。
在經產母馬中，直腸觸診仍然很重要，因為必須能夠檢測到發育中的卵泡的一致性。大多數情況下，小型母馬的直腸觸診不是一種選擇，因此我們僅依靠超聲圖像的大小。
獸用B超機對母馬懷孕檢測：
雖然胚胎在第 11 到 14 天可以看到，但到第 15 到 17 天，胚胎囊泡已經固定在子宮壁上，更容易看到。到第 24 天，可以看到心跳以驗證是否存在活胎兒。早期胎兒可能被誤認為是子宮囊腫，反之亦然。可以定期檢查母馬是否增加了囊泡大小。這可以將囊腫與真正的懷孕區分開來。當意識到母馬的熱循環持續時間約為 21 天時，可以***好地理解超聲波的重要性。
沒有懷孕可以決定在隨后的發情循環中重新繁殖母馬。到妊娠第 60 至 78 天時，可以在靠近肛門的位置看到胎兒生殖器結節 (FGT) 以確認是否存在雌性小馬駒，或在靠近臍部的位置觀察到是否存在雄性小馬駒。從第 80 天起，可以通過將探頭放置在腹部，剛好在乳房的頭側來使用經腹超聲。定期經直腸和經腹超聲檢查胎兒心跳可用于確認活胎。
盡管雙胞胎在子宮內并排或重疊在一起時可能很難觀察到，但通常我們可以將它們想象成單獨的實體。一些數據表明，94% 的雙胞胎妊娠會導致兩個胎兒流產或死產。如果允許雙胎妊娠在沒有干預的情況下進行，母馬通常會將小馬駒帶到八或九個月，然后兩個胎兒都會流產。即使母馬將雙胞胎帶到足月，也只有 8% 的人會出生并存活兩周以上。
如果看到母馬的雙胞胎胚胎，可能會手動將它們經直腸分離，并捏住較小的胚胎導致死亡。這個程序通常在第17天之前進行。純種馬因雙胞胎而臭名昭著（3.5%），其次是標準馬，只有1%。幸運的是，小型母馬很少雙胞胎，因為這個品種的胎兒減少（捏）是困難的。
獸用B超機檢測母馬子宮囊腫：
子宮囊腫雖然通常是無害的，但會干擾胎兒與子宮的附著，并且很容易用超聲波觀察到。感染性或特發性子宮內膜炎引起的子宮內液體潴留也可以通過經直腸超聲檢查進行觀察。一些種馬精液對母馬子宮的刺激性足以引起子宮內膜炎。如果可以看到液體潴留，那么可以通過宮內輸注、鹽水沖洗子宮和/或催產素來治療母馬，以增強子宮體的張力。***后，使用超聲檢查，可以評估產后母馬的子宮張力以及它們在隨后的“小馬熱”中“繁殖”的能力。
